Fødselaren har de seneste 45 år været aktiv som forsker og underviser. Siden 1991 på Københavns Universitet, hvor arbejdsområdet har ligget indenfor skovøkologi og skovdyrkning, primært med problemstillinger knyttet til udvikling af bæredygtige skovdriftsmetoder samt tilpasning af træer og skove til klimaændringer.
Han var idémand til at udvikle et sæt kriterier og indikatorer for bæredygtig skovdrift, som blev fremlagt på OECD-konferencen i den canadiske by Montreal i 1993 (Montrealprocessen). Det blev grundskemaet for tilsvarende processer i andre dele af verden.
Internationalt har Jørgen Bo Larsen de seneste 20 år været engageret i skovrelaterede problemstillinger på verdensplan. Det er bl.a. sket som bestyrelsesmedlem i Center for International Forest Research (CIFOR) i Indonesien og i World Agroforestry Center (ICRAF) i Kenya, som begge er medlem i en verdensomspændende kæde af 15 centre for landbrugsforskning, der gennem årene var modtaget betydelig udviklingsstøtte fra Danida.
Fra september i fjor er han ikke længere på lønningslisten på universitetet. Det giver ham tid til at påtage sig nye opgaver såsom at være med til at internationalisere Nanjing Forestry University i Kina.