Elfenbenskysten var i 2004 delt af en borgerkrig og FN-styrken blev sat ind for bl.a. at bemande en bufferzone mellem den sydlige del af landet, der var under regeringens kontrol og den nordlige del af landet, der var under oppositionens kontrol. Parterne havde indgået våbenhvile.
Undervejs til 2017 har landet og missionen været gennem flere kriser.
I 2006 udbrød er voldelige optøjer efter parlamentet – med FN’s støtte – blev opløst, da dets mandat var udløbet. Mange FN-folk blev evakueret og FN’s sikkerhedsråd besluttede at sende flere soldater til styrken.
I 2010 udbrød der atter borgerkrig, da den siddende præsident Laurent Gbagbo nægtede at anerkende et valgnederlag til Alassane Ouattara. Gbagbo overgav sig til sidst og i maj 2011 blev Gbagbo indsat som præsident. Konflikten kostede omkring 3.000 personer livet og sendte 300.000 på flugt.
Siden da har der været gennemført valg i 2011 og i 2016 og mange medlemmer af væbnede grupper er blevet afvæbnet og integreret i det civile samfund.
Når UNOCI forlader Elfenbenskysten overlader det nogle af sine aktiviteter til FN’s kontor i landet.