Fødselaren er en af pionererne indenfor en metode til proteinanalyse, kaldet massespektrometri. Da han begyndte herpå i 1967 blev det betragtet som helt umuligt.
I samarbejde med fysikere på Uppsala Universitet lykkedes det at få et gennembrud for metoden omkring 1980 og i dag er det en standardmetode i proteinlaboratorier og bioteknologiske virksomheder verden over.
Roepstorff ledede en proteinforskingsgruppe på Syddansk Universitet (SDU) frem til 2006 for at kunne hellige sig sin forskning, herunder deltagelse i Galathea 3 ekspeditionen, hvilket var opfyldelsen af en drengedrøm.
Han deltog med et projekt, hvor der skulle findes lysende – eller fluorescerende – proteiner i koralrev
Roepstorff har været gæsteprofessor i Brasilien og Kina. Via sine brasilianske kontakter er han blevet involveret i analyser af mærkværdige giftige dyr og planter.
I Kina er han involveret i Sino Danish Center (et dansk-kinesisk universitet) som principal coordinator for life science. Mere på
http://sdc.university
Hans ansættelse som professor på SDU er netop forlænget endnu to år.
